Den japanske navn for en japansk Bobtail kat er en Mi-Ke kat. Katte kom til Japan fra Kina eller Korea over tusind år siden. Ingen ved, om de japanske Bobtail kat havde hans karakteristiske bobtail da han først ankom til Japan. Det er muligt, at bobtail er en nyere mutation.

Katteudstillinger blev populær efter Anden Verdenskrig, fordi der var mange amerikanske personale udstationeret i Japan. Japanske folk var mest interesseret i fremmede katte indtil 1960'erne, da amerikanske dommere fandt en interesse i det japanske Bobtail kat. Af 1971, var der en række japanske Bobtail katte i Amerika og avl denne kat blev mere almindeligt.